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    科研進展

    華南植物園發現系統發育基因組學和形態學證據支持亞洲產崖豆藤屬劃分為3個屬

    發布時間:2024-12-16 作者:scbg 來源:華南植物園

    崖豆藤屬Millettia隸屬于豆科蝶形花亞科核心崖豆藤族(core Millettieae)。該屬是一個分類復雜的大屬,全世界約有150種,分布于亞洲和非洲。以往的研究已經表明崖豆藤屬在形態上高度多樣,分子證據也證明該屬是高度多系。2005年,英國邱園出版的《世界豆類》被譽為豆科植物的百科全書,該專著明確指出崖豆藤屬的分類迫切需要大修(major revision)。

    中國科學院華南植物園助理研究員宋柱秋與合作者,從2013年開始著手研究,基于大量的館藏標本、野外調查和分子系統學研究,陸續獲得該屬在分類上的一些進展,主要包括:(1)建立一個新屬——啟明豆屬Huchimingia(Song et al. 2022a. Phytotaxa 532: 37-56),僅5種,包括此前描述的1個喬木新種韋直啟明豆(Song et al. 2019. Nordic Journal of Botany 35: 404-410),以及1個中國新記錄種柄果啟明豆;(2)將部分種轉移或歸并至至魚藤屬Derris,如厚果崖豆藤、榼藤子崖豆藤、Millettia boniana等?(Song & Pan 2022. Phytotaxa 531: 230-248);(3)恢復白崖豆屬Imbraylx的屬級地位(Song 2021. Phytotaxa 525: 223-231),該屬隸屬于核心崖豆藤族的刀豆氨酸群(Canavanine group),區別于崖豆藤屬所在的非刀豆氨酸群(Non-canavanine group);(4)將無患子崖豆藤歸并至云南魚藤,并首次對此種的系統位置提出質疑(Song et al. 2017a. Nordic Journal of Botany 35: 404-410),后來該種被其他研究者搶先發表為新屬——異齒豆屬Ohashia;(5)證明瀾滄崖豆藤是一個混雜的種,花標本屬于草崖豆藤Cruddasia insignis,果標本屬于球子雞血藤Callerya sphaerosperma,由于花標本被指定為模式標本,因此將該種歸并到草崖豆藤,由此報道草崖豆藤屬為中國新記錄屬(Song et al. 2021a. Phytotaxa 497: 29-38);(6)綜述了越南和印度產崖豆藤屬的現狀(Song et al. 2022b. Phytotaxa,571,169-185;Song 2023a. Phytotaxa 591: 55-63),澄清了該屬其他一些種級水平的分類問題(Song et al. 2017b. Phytotaxa 32: 51-58;Song et al. 2021b. Phytotaxa 507: 183-190);(7)也對崖豆藤屬的近緣屬——短翅魚藤屬進行了分類學研究(Song 2023b. Phytotaxa 484: 251-263)。但是已有的這些研究依然未能解決亞洲產崖豆藤屬多數種的歸屬問題,該屬剩余的亞洲三個組也均不是單系類群,需要進一步研究。

    近期,基于第二代測序數據提取了完整的葉綠體基因組和2000余個單拷貝核基因,在核心崖豆藤族完整屬級取樣的情況下,解決了亞洲產崖豆藤屬的分類。該研究主要結果包括:(1)重新界定了核心崖豆藤族的范圍,正式將菜豆族擬大豆亞族的3個屬(Cruddasia,?OphrestiaPseudoeriosema)納入核心崖豆藤族的范圍,將核心崖豆藤族分為2群(刀豆氨酸群和非刀豆氨酸群)5個分支及14個亞支,總共包含29個屬約1000種;(2)亞洲產崖豆藤屬種類聚成3個高支持率的亞支,并得到形態證據的支持,因此這三個亞支被處理為三個屬,即水黃皮屬Pongamia(56種)、耳旗豆屬Otosema(3種)和狹義崖豆藤屬Millettia?s.str.(7種),并將干花豆屬Fordia和糠皮豆屬Ibatiria歸并到水黃皮屬,共建立了56個新組合和2個新名稱。(3)基于分化時間估計,推測核心崖豆藤族的一個主要分支(clade VII)經歷了早期的快速分化,該分支涉及崖豆藤族的三個長期有分類爭議的中心屬,即廣義崖豆藤屬、廣義魚藤屬Derris?s.lato和廣義醉魚豆屬Lonchocarpus?s.lato。因此推測這種基于形態上的有爭議的分類處理,可能與快速分化導致的復雜的形態性狀演化有關。

    相關研究成果已近期發表在國際知名期刊Molecular Phylogenies and Evolution(《分子系統發育與進化》)上。華南植物園宋柱秋為第一作者,合作者包括華南植物園李世晉研究員,徐連升助理研究員,科研助理蔣凱文,復旦大學趙義勇博士,武漢植物園李湉博士,印度馬拉巴爾植物園和植物科學研究所A.P. Balan博士,以及法國國家自然歷史博物館M. Gaudeul博士。該研究得到了廣東省基礎與應用基礎研究旗艦項目的支持。論文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S105579032400246X

    圖1. 基于完整葉綠體基因組的核心崖豆藤族的系統發育關系

    圖2. 基于2106個單拷貝核基因的核心崖豆藤族的系統發育關系

    圖3. 核心崖豆藤族的分化時間估計





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